La gestión de este impuesto para los contribuyentes con EP en territorio español es similar a la del IS, es decir, los sujetos pasivos están obligados a declarar las rentas obtenidas y a ingresar las cuotas que se deriven de la declaración.
La gestión para los contribuyentes que obtienen sus rentas en territorio español sin EP implica la obligación de realizar declaración del IRNR por cada renta sujeta a tributación. No obstante, en general, los pagadores de rendimientos a los no residentes están obligados a practicar retención o ingresos cuenta en las rentas sujetas a tributación que, en la mayoría de los casos, coincide con el impuesto definitivo, y exime al contribuyente de la obligación de presentar declaración.